Sa molecular biology, ang STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) ay isang biological database at web resource ng kilala at hinulaang pakikipag-ugnayan ng protina-protina. … Ang pinakabagong bersyon 11b ay naglalaman ng impormasyon sa humigit-kumulang 24, 5 milyong protina mula sa higit sa 5000 mga organismo.
Ano ang layunin ng STRING database?
Layunin ng STRING database ang na kolektahin at pagsamahin ang impormasyong ito, sa pamamagitan ng pagsasama-sama ng kilala at hinulaang protina–data ng pagkakaugnay ng protina para sa malaking bilang ng mga organismo.
Ano ang STRING score?
Sa STRING, ang bawat pakikipag-ugnayan ng protina-protein ay may anotasyon ng isa o higit pang 'mga marka'. Mahalaga, ang mga markang ito ay hindi nagsasaad ng lakas o pagiging tiyak ng pakikipag-ugnayan. Sa halip, ang mga ito ay mga tagapagpahiwatig ng kumpiyansa, ibig sabihin, kung gaano malamang na husgahan ng STRING na totoo ang isang pakikipag-ugnayan, dahil sa magagamit na ebidensya.
Bakit nakikipag-ugnayan ang mga protina?
Ang
Protein–protein interaction (PPIs) ay physical contacts of high specificity na itinatag sa pagitan ng dalawa o higit pang mga molekula ng protina bilang resulta ng mga biochemical na kaganapan na pinangunahan ng mga pakikipag-ugnayan na kinabibilangan ng electrostatic forces, hydrogen bonding at ang hydrophobic effect.
Ano ang functional association?
kahulugan. Binary na ugnayan sa pagitan ng mga biyolohikal na nilalang kapag ang isa sa kanila ay nagmodulate sa isa pa sa mga tuntunin ng paggana, pagpapahayag, pagkasira o katatagan ng isa at ang kaugnayansa pagitan ng mga kasosyo ay hindi maaaring matiyak na direkta, kaya ang mga intermediate na hakbang ay hayagang naroroon.
