Sa kabaligtaran, karamihan sa mga eukaryotic DNA ligases, kasama ang archaeal at bacteriophage enzymes, ay nabibilang sa pangalawang sub-family; ang mga enzyme na ito ginagamit ang ATP bilang cofactor.
Nangangailangan ba ang mga ligase ng ATP?
Dalawang DNA ligase ang karaniwang ginagamit. … Ang T4 ligase ay nangangailangan ng ATP habang ang E. coli ligase ay nangangailangan ng NAD+ (Ang Nicotinamide adenine dinucleotide ay isang coenzyme na binubuo ng 2 nt na pinagsama sa pamamagitan ng kanilang mga phosphate group). Parehong pinapagana ang pagsasama ng isang 5′-phosphate at isang 3′-OH na grupo upang bumuo ng isang phosphodiester bond.
Bakit kailangan ng ligase ng ATP?
Ang dalawang hakbang ng DNA ligation reaction
Ang DNA ligation reaction mismo ay may dalawang pangunahing hakbang. Una ang mga dulo ng DNA ay kailangang magkabanggaan kung nagkataon at manatiling magkasama nang sapat para sa ligase na makasali sa kanila. … Upang payagan ang enzyme na magsagawa ng karagdagang mga reaksyon, ang AMP sa aktibong site ng enzyme ay dapat na mapunan muli ng ATP.
Ano ang function ng ligases?
Ang
DNA ligases ay may mahalagang papel sa pagpapanatili ng genomic integrity sa pamamagitan ng pagsali sa mga break sa phosphodiester backbone ng DNA na nangyayari sa panahon ng replication at recombination, at bilang resulta ng pagkasira ng DNA at nito pagkukumpuni. Tatlong gene ng tao, ang LIG1, LIG3 at LIG4 ay nag-encode ng mga ligase ng DNA na umaasa sa ATP.
Ano ang mga ligase na aktibo o pasibo ang kanilang ginagawa?
Ang
DNA ligase ay aktibo sa panahon ng replication, proseso ng pagkumpuni at recombination ng DNA. Ito ay malawakang inilapat sa pag-aayos ng single-strandsinisira ang duplex DNA ng mga buhay na organismo gamit ang complementary strand ng double helix bilang template, habang ang ilang form ay maaaring partikular na ayusin ang double-strand damages.
