Ang mga peptide bond ay may planar, trans, configuration at sumasailalim sa napakakaunting pag-ikot o pag-ikot sa paligid ng amide bond na nag-uugnay sa α-amino nitrogen ng isang amino acid sa carbonyl carbon ng susunod (Figure 4-1).
Bakit ipinagbabawal ang pag-ikot tungkol sa peptide bond?
Bakit ipinagbabawal ang pag-ikot tungkol sa peptide bond, at ano ang mga kahihinatnan ng kakulangan ng pag-ikot? Ang peptide bond ay may partial double bond character, na pumipigil sa pag-ikot. Pinipigilan ng kakulangan ng pag-ikot na ito ang mga conformation ng peptide backbone at nililimitahan ang mga posibleng istruktura.
Maaari bang Mabaluktot ang mga peptide bond?
Dahil ang gulugod ng polypeptide, na pinagsasama-sama ng mga peptide bond, ay flexible (dahil sa "pag-ikot ng lahat ng mga bono na iyon"), ang chain ay maaaring yumuko, mapilipit, at ibaluktot sa napakaraming uri ng tatlong dimensyong hugis.
Mababalik ba ang mga peptide bond?
Bagaman ang peptide bond formation ay maaaring baligtarin sa pamamagitan ng pagdaragdag ng tubig (hydrolysis), ang mga amide bond ay napaka-stable sa tubig sa neutral na pH, at ang hydrolysis ng mga peptide bond sa mga cell ay kinokontrol din ng enzymatically.
May directionality ba ang mga peptide bond?
Kahit na maayos ang geometry ng peptide group, maaaring umikot ang mga bond sa magkabilang gilid ng mga alpha carbon. Nagbibigay-daan ito sa flexibility sa peptide backbone. … Ang pagkakasunud-sunod ng mga amino acid sa protina ay may direksyon ooryentasyon na tinutukoy ng mga functional na grupo sa mga dulo ng chain.
