Saan matatagpuan ang mga site ng hypersensitivity ng DNase I at ano ang ipinahihiwatig ng mga ito tungkol sa katangian ng chromatin? Ang mga site na ito ay matatagpuan sa ang exon-intron junctions at ipahiwatig ang site ng mRNA cleavage sa panahon ng splicing. Ang mga site na ito ay random na matatagpuan sa buong genome at ginagawa nitong madaling masira ang DNA.
Ano ang isang DNase I hypersensitive na site at paano ito nakakaapekto sa chromatin?
Sa genetics, ang DNase I hypersensitive sites (DHSs) ay mga rehiyon ng chromatin na sensitibo sa cleavage ng DNase I enzyme. Sa mga partikular na rehiyong ito ng genome, nawala ang chromatin ng condensed structure nito, na naglalantad sa DNA at ginagawa itong accessible.
Ano ang iminumungkahi ng isang DNase hypersensitive na site?
Ang mga aktibong elemento ng cis-regulatory ay sobrang sensitibo sa cleavage ng endonuclease DNase I. Ang mga motif sa loob ng DNase I na mga hypersensitive na site ay nagpapahiwatig ng potensyal na trans-acting factor occupancy at, kapag pinagsama sa DNase I cleavage data, ay maaaring gamitin upang bumuo ng mga pansamantalang regulatory network.
Ano ang DNase hypersensitivity assay?
Sa loob ng mahigit dalawang dekada, ang DNase I hypersensitivity assay (DHA) ay instrumental para sa pagtuklas ng mga regulatory domain (11). Ang pamamaraang ito ay nagmamapa ng mga discrete na site sa genome kung saan ang conformation ng chromatin ay nagiging hypersensitive ang DNA nito sa cleavage ng endonuclease DNase I (12).
Ano ang isang nuclease hypersensitive na site sa chromatin?
Sachromatin, ang mga rehiyong walang nucleosome na kilala bilang mga nuclease hypersensitive na site ay pinaniniwalaan na na kumakatawan sa "mga bukas na bintana" na nagbibigay-daan sa pinahusay na pag-access ng mahahalagang resident cis-acting na mga sequence ng DNA sa mga trans-acting factor (tingnan ang Refs.
