Ang proline ay kadalasang matatagpuan sa dulo ng α helix o paikot-ikot o loop. Hindi tulad ng ibang mga amino acid na halos eksklusibong umiiral sa pagbabago sa polypeptides, ang proline ay maaaring umiral sa cis-configuration sa peptides.
Naglalaman ba ang mga alpha helice ng proline residues?
Ngayong may mahigit 30, 000 na istruktura ng protina sa Protein Data Bank, malinaw na ang proline residues ay naroroon sa α-helice, kung saan madalas silang gumaganap ng mahahalagang tungkulin sa istraktura at paggana ng protina.
Anong mga amino acid ang nasa alpha helices?
Alinman sa 20 amino acid ay maaaring lumahok sa isang α-helix ngunit ang ilan ay mas pinapaboran kaysa sa iba. Ang Ala, Glu, Leu, at Met ay kadalasang matatagpuan sa mga helice samantalang, mas malamang na makita sina Gly, Tyr, Ser, at Pro.
Naglalaman ba ang mga beta sheet ng proline?
Ang Proline ay hindi pinapaboran sa mga istruktura ng beta sheet dahil hindi nito makumpleto ang H-bonding network. Kapag nangyari ang proline sa mga sheet, maaaring ito ay nasa umbok o gilid ng sheet kung saan ang kakulangan ng isang doner ng amino hydrogen bond ay hindi kritikal.
Ano ang naglalaman ng mga alpha helice?
Ang alpha helix (α-helix) ay isang karaniwang motif sa ang pangalawang istraktura ng mga protina at isang kanang hand-helix na conformation kung saan ang bawat backbone N−H group na hydrogen mga bono sa gulugod C=O. pangkat ng amino acid na matatagpuan sa apat na residue nang mas maaga sa pagkakasunud-sunod ng protina.
